文書の過去の版を表示しています。
Gromacs
概要
- フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのソフトウェアパッケージ
- 生体分子の分子動力学シミュレーションパッケージといえば、AMBER と Gromacs ってぐらい有名なパッケージ
インストール
簡単な方法
$ sudo apt-get install gromacs gromacs-data gromacs-mpich gromacs-openmpi
- ただし、バージョンが Ubuntu のリポジトリで固定されてしまうため、最新版を扱いたい場合は、Gromacs 5.1.2 インストール方法 (Ubuntu 14.04) を参照
手動インストール
- 環境: Ubuntu 16.04 (64 bit)
Openmpi のインストール
- 公式サイトからパッケージを入手する。