目次

Discovery Studio Visualizer

概要

入手方法

  1. BIOVIA Discovery Studio を使用した創薬プロセスの改善」 から「製品ダウンロード」→「Free BIOVIA Software」→「request a free copy of Discovery Studio Visualizer and ActiveX Control」
  2. 必要事項を入力して「Submit」
  3. ダウンロードリンクが入ったメールが送られてくる

インストール方法

操作

マウス操作 サブキー 機能
クリック 単数の原子を選択
Shift複数の原子を選択
ドラッグ 単数及び複数の原子を囲んで選択
Shift,Ctrl単数及び複数の原子を囲んで追加選択
右ドラッグ 画面に垂直な軸で回転
Shift画面を中心に分子を回転
Ctrl座標を変えて分子を回転 (PDB などに保存すると座標が変わっている)
中ボタンドラッグ 水平移動
Shift拡大縮小
Ctrl選択した原子(分子)を変形
スクロール拡大縮小

Tips

ライセンスエラー対策

  1. ライセンスパックのインストールウィザードを起動する。
    $ cd /opt/BIOVIA/DiscoveryStudio
    $ ls
    Logs  Uninstaller  bin  buildinfo.txt  etc  lib  lp_installer  share
    $ cd lp_installer
    $ ./lp_setup_linux.sh
  2. ウィザードに従い、ライセンスパックをインストールする。
    • 今回は、/opt/BIOVIA/LicensePack にインストールした。
  3. csh をインストールする。
    $ sudo apt install csh
  4. ライセンスを適用する。
    $ cd /opt/BIOVIA/LicensePack/etc
    $ ./lp_config
    $ ./lp_echovars
  5. ライセンス場所の変更を適用する。
    $ cd /opt/BIOVIA/DiscoveryStudio/bin
    $ ./config_lp_location /opt/BIOVIA/LicensePack

ZLIB_1.2.9 対策

  1. zlib-1.2.9 をダウンロードする。
  2. コンパイル&インストールする。
    $ tar axvf zlib-1.2.9.tar.gz
    $ cd zlib-1.2.9/
    $ ./configure
    $ make
    $ sudo make install
  3. LD_LIBRARY_PATH/usr/local/lib のパスを追加する。