python:parmed

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python:parmed [2023/02/15 14:03] – [PDB からリガンドの座標を抽出する] mumeiyamibitopython:parmed [2025/05/27 13:26] (現在) – [特定部位の削除] mumeiyamibito
行 77: 行 77:
 <code python>object.strip("AMBER_MASK")</code> <code python>object.strip("AMBER_MASK")</code>
   * ''AMBER_MASK'': 削除する部位の Amber mask   * ''AMBER_MASK'': 削除する部位の Amber mask
 +  * 番号で残基や原子を指定する場合、PDB 記載の番号ではなく、1 から始まる先頭から何番目かという番号になる。
  
  
  • python/parmed.txt
  • 最終更新: 2025/05/27 13:26
  • by mumeiyamibito