分子シミュレーション関連:gromacs:gromacs計算手順_ver.5

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分子シミュレーション関連:gromacs:gromacs計算手順_ver.5 [2018/12/04 10:39] mumeiyamibito分子シミュレーション関連:gromacs:gromacs計算手順_ver.5 [2024/11/25 12:55] (現在) – [MD 計算の延長] mumeiyamibito
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     * ''-cpi PREVIOUS.cpt'': チェックポイントファイル (PREVIOUS.cpt) の指定     * ''-cpi PREVIOUS.cpt'': チェックポイントファイル (PREVIOUS.cpt) の指定
       * PREVIOUS.cpt は前の計算が完了した際に作成されている       * PREVIOUS.cpt は前の計算が完了した際に作成されている
-      * tpr 自体は延長分を足し合わせた計算をするようになっている。.cpt を指定しないと最初から延長分までの計算をすることになるため、<html><span style="color: red; font-weight: bold">cpi の指定を忘れないこと!</span></html>\\ 例+      * tpr 自体は延長分を足し合わせた計算をするようになっている。.cpt を指定しないと最初から延長分までの計算をすることになるため、**cpi の指定を忘れないこと!**\\ 例
         * 0〜10 ns の計算をする .tpr に 10 ns を追加する convert-tpr を実行してできた NEXT.tpr を作成         * 0〜10 ns の計算をする .tpr に 10 ns を追加する convert-tpr を実行してできた NEXT.tpr を作成
           * ''gmx mdrun -s NEXT.tpr -deffnm DEFNAME'' -> 0〜20 ns の計算を実行           * ''gmx mdrun -s NEXT.tpr -deffnm DEFNAME'' -> 0〜20 ns の計算を実行
  • 分子シミュレーション関連/gromacs/gromacs計算手順_ver.5.1543887593.txt.gz
  • 最終更新: 2018/12/04 10:39
  • by mumeiyamibito