| 両方とも前のリビジョン 前のリビジョン 次のリビジョン | 前のリビジョン |
| 分子シミュレーション関連:環境構築:torque_旧pbs:コンパイルによる導入 [2016/07/19 13:29] – mumeiyamibito | 分子シミュレーション関連:環境構築:torque_旧pbs:コンパイルによる導入 [2017/03/28 17:50] (現在) – [GPUノードでの手順] mumeiyamibito |
|---|
| * ノード側: torque-mom | * ノード側: torque-mom |
| - [[分子シミュレーション関連/環境構築/Torque (旧PBS)/サーバの設定|サーバの設定]] | - [[分子シミュレーション関連/環境構築/Torque (旧PBS)/サーバの設定|サーバの設定]] |
| | |
| | ===== GPUノードでの手順 ===== |
| | * [[#手順]] の 5 の configure が異なる |
| | |
| | - nvml のために、CUDA の他に GPU develop kit を [[https://developer.nvidia.com/gpu-deployment-kit | GPU Deployment Kit | NVIDIA Developer]] からダウンロード |
| | - GPU develop kit のインストール\\ <code bash>$ chmod +x linux_amd64_352_79_release.run |
| | $ sudo ./linux_amd64_352_79_release.run</code> |
| | - コンパイル情報のクリア\\ <code bash>$ cd torque-6.0.1-1456945733_daea91b |
| | $ make distclean</code> |
| | - インストールのための設定\\ <code bash>$ ./configure --prefix=/usr/local --with-default-server=hoge --enable-nvidia-gpus --with-nvml-include=/usr/include/nvidia/gdk --with-nvml-lib=/usr/lib/x86_64-linux-gnu --with-hwloc-path=/usr/include</code> |
| | * ''--prefix'': インストール先 (今回は /usr/local 以下に bin や lib が展開するようにした) |
| | * ''--with-default-server'': サーバ名 (apt-get でインストールした際の /var/spool/torque/server_name の設定が不要になる) |
| | * ''--enable-nvidia-gpus'': torque-mom で GPU を使うノード |
| | * ''--with-nvml-include'': nvml のインクルードファイルのあるディレクトリのパス |
| | * ''--with-nvml-lib'': nvml のライブラリファイルのあるディレクトリのパス |
| | * ''--with-hwloc-path'': hwloc のあるディレクトリのパス |
| | - [[#手順]] の 6 以降の作業を GPU ノードで実行 |
| | |
| | ===== 参考サイト ===== |
| | * Torque のインストール\\ [[http://www.cr.ie.u-ryukyu.ac.jp/~game/pukiwiki/index.php?Torque | Torque - Game Lab -PukiWiki-]] |
| | * マシン起動時のスクリプト起動\\ [[http://mower.hateblo.jp/entry/2015/05/08/111025 | 【Ubuntu】OS起動時に自作スクリプトを動かす - ムーワァとデーヴァの私生活]] |
| | * Torque インストール時のエラー\\ [[http://chenmingzhang.blogspot.jp/2015/01/setup-torquemaui-system.html | some tips on learning linux/bsd/solaris: Setup torque/maui system _debug the system]] |
| | * GPU ノードでのインストール\\ [[http://docs.adaptivecomputing.com/torque/4-0-2/Content/topics/3-nodes/NVIDIAGPGPUs.htm | TORQUE NVIDIA GPGPUs]] |
| | |
| | {{tag>Linux サーバ 分子シミュレーション}} |