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| 分子シミュレーション関連:環境構築:torque_旧pbs:コンパイルによる導入 [2016/07/19 12:33] – mumeiyamibito | 分子シミュレーション関連:環境構築:torque_旧pbs:コンパイルによる導入 [2017/03/28 17:50] (現在) – [GPUノードでの手順] mumeiyamibito | ||
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| ====== コンパイルによる導入 ====== | ====== コンパイルによる導入 ====== | ||
| + | ===== apt-get と異なる点 ===== | ||
| + | * apt-getによる導入 では、サーバとノードでインストールするパッケージが異なった | ||
| + | * コンパイルによる導入では、サーバとノードに同じものをインストールするが、それぞれの実行ファイルの起動の ON/OFF を制御することで、サーバとノードを分ける | ||
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| + | ===== 手順 ===== | ||
| <note warning> | <note warning> | ||
| + | - ホスト名の設定\\ <code bash>$ sudoedit / | ||
| + | * 127.0.0.1 は localhost からホスト名に変更 | ||
| + | * 127.0.1.1 はコメントアウト | ||
| + | * ノードのホスト名も入れていく | ||
| - パッケージを [[http:// | - パッケージを [[http:// | ||
| * ここでは、「torque-6.0.1-1456945733_daea91b.tar.gz」というファイル名でホームにダウンロードしたとする) | * ここでは、「torque-6.0.1-1456945733_daea91b.tar.gz」というファイル名でホームにダウンロードしたとする) | ||
| 行 274: | 行 283: | ||
| * サーバ側 (サーバでジョブを処理させない場合): | * サーバ側 (サーバでジョブを処理させない場合): | ||
| * ノード側: | * ノード側: | ||
| - | - * [[分子シミュレーション関連/ | + | - [[分子シミュレーション関連/ |
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| + | ===== GPUノードでの手順 ===== | ||
| + | * [[#手順]] の 5 の configure が異なる | ||
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| + | - nvml のために、CUDA の他に GPU develop kit を [[https:// | ||
| + | - GPU develop kit のインストール\\ <code bash>$ chmod +x linux_amd64_352_79_release.run | ||
| + | $ sudo ./ | ||
| + | - コンパイル情報のクリア\\ <code bash>$ cd torque-6.0.1-1456945733_daea91b | ||
| + | $ make distclean</ | ||
| + | - インストールのための設定\\ <code bash>$ ./configure --prefix=/ | ||
| + | * '' | ||
| + | * '' | ||
| + | * '' | ||
| + | * '' | ||
| + | * '' | ||
| + | * '' | ||
| + | - [[#手順]] の 6 以降の作業を GPU ノードで実行 | ||
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| + | ===== 参考サイト ===== | ||
| + | * Torque のインストール\\ [[http:// | ||
| + | * マシン起動時のスクリプト起動\\ [[http:// | ||
| + | * Torque インストール時のエラー\\ [[http:// | ||
| + | * GPU ノードでのインストール\\ [[http:// | ||
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| + | {{tag> | ||