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| 分子シミュレーション関連:環境構築:gromacs_2025.2 [2025/07/28 23:45] – mumeiyamibito | 分子シミュレーション関連:環境構築:gromacs_2025.2 [2025/07/28 23:48] (現在) – mumeiyamibito | ||
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| 行 5: | 行 5: | ||
| * OpenMPI: 5.0.8 | * OpenMPI: 5.0.8 | ||
| * FFTW: Gromacs インストーラでの自動インストール | * FFTW: Gromacs インストーラでの自動インストール | ||
| - | * 作業ディレクトリ: | + | * 作業ディレクトリ: |
| - | * インストール先: | + | * インストール先: |
| * シェル環境: | * シェル環境: | ||
| 行 31: | 行 31: | ||
| </ | </ | ||
| - 設定ファイルに以下を追記する。 | - 設定ファイルに以下を追記する。 | ||
| - | * bash の場合 (''' | + | * bash の場合 ('' |
| export LD_LIBRARY_PATH $LD_LIBRARY_PATH / | export LD_LIBRARY_PATH $LD_LIBRARY_PATH / | ||
| </ | </ | ||
| - | * fish の場合 (''' | + | * fish の場合 ('' |
| set -gx LD_LIBRARY_PATH $LD_LIBRARY_PATH / | set -gx LD_LIBRARY_PATH $LD_LIBRARY_PATH / | ||
| </ | </ | ||
| - 設定を適用する。\\ <code bash> | - 設定を適用する。\\ <code bash> | ||
| - | * bash の場合 (''' | + | * bash の場合 ('' |
| $ source $HOME/ | $ source $HOME/ | ||
| </ | </ | ||
| - | * fish の場合 (''' | + | * fish の場合 ('' |
| $ source $HOME/ | $ source $HOME/ | ||
| </ | </ | ||
| 行 99: | 行 99: | ||
| * fish の場合 | * fish の場合 | ||
| - {{ : | - {{ : | ||
| - | - 展開して、''' | + | - 展開して、 '' |
| - | - '''/ | + | - ''/ |
| - 以下のコマンドを実行する。\\ <code bash> | - 以下のコマンドを実行する。\\ <code bash> | ||
| $ source / | $ source / | ||