http://metallocrystal.pug-chimera.ts.net/ Sat, 04 Apr 2026 10:05:30 +0000 FeedCreator 1.8 http://metallocrystal.pug-chimera.ts.net/_media/logo.png http://metallocrystal.pug-chimera.ts.net/ http://metallocrystal.pug-chimera.ts.net/%E5%88%86%E5%AD%90%E3%82%B7%E3%83%9F%E3%83%A5%E3%83%AC%E3%83%BC%E3%82%B7%E3%83%A7%E3%83%B3%E9%96%A2%E9%80%A3/%E7%92%B0%E5%A2%83%E6%A7%8B%E7%AF%89/gromacs_2025.2?rev=1753714122&do=diff Gromacs 2025.2 のインストール方法 インストール環境 * OS: LinuxMint 22.1 * Gromacs: 2025.2 * OpenMPI: 5.0.8 * FFTW: Gromacs インストーラでの自動インストール * 作業ディレクトリ: $HOME/opt * インストール先: mumeiyamibito@undisclosed.example.com (mumeiyamibito) Mon, 28 Jul 2025 14:48:42 +0000 http://metallocrystal.pug-chimera.ts.net/%E5%88%86%E5%AD%90%E3%82%B7%E3%83%9F%E3%83%A5%E3%83%AC%E3%83%BC%E3%82%B7%E3%83%A7%E3%83%B3%E9%96%A2%E9%80%A3/%E7%92%B0%E5%A2%83%E6%A7%8B%E7%AF%89/gromacs?rev=1753712224&do=diff Gromacs 概要 * フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのソフトウェアパッケージ * 生体分子の分子動力学シミュレーションパッケージといえば、AMBER と Gromacs ってぐらい有名なパッケージ mumeiyamibito@undisclosed.example.com (mumeiyamibito) Mon, 28 Jul 2025 14:17:04 +0000