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Discovery Studio
概要
- 様々な計算ツールと連携できる分子ビューア
- ビューアだけなら無料 (それでも十分に多機能なのですが…)
入手方法
- 「 BIOVIA Discovery Studio を使用した創薬プロセスの改善」 から「製品ダウンロード」→「Free BIOVIA Software」→「request a free copy of Discovery Studio Visualizer and ActiveX Control」
- 必要事項を入力して「Submit」
- ダウンロードリンクが入ったメールが送られてくる
操作
| マウス操作 | サブキー | 機能 |
|---|---|---|
| クリック | 単数の原子を選択 | |
| Shift | 複数の原子を選択 | |
| ドラッグ | 単数及び複数の原子を囲んで選択 | |
| Shift,Ctrl | 単数及び複数の原子を囲んで追加選択 | |
| 右ドラッグ | 画面に垂直な軸で回転 | |
| Shift | 画面を中心に分子を回転 | |
| Ctrl | 座標を変えて分子を回転 (PDB などに保存すると座標が変わっている) | |
| 中ボタンドラッグ | 水平移動 | |
| Shift | 拡大縮小 | |
| Ctrl | 選択した原子(分子)を変形 | |
| スクロール | 拡大縮小 | |
- 上記の操作は、ビューツールバーで、矢印(選択モード)(下記画像)になっている場合
Tips
ライセンスエラー対策
- インストール先が
/opt/BIOVIA/DiscoveryStudioとする。
- ライセンスパックのインストールウィザードを起動する。
$ cd /opt/BIOVIA/DiscoveryStudio $ ls Logs Uninstaller bin buildinfo.txt etc lib lp_installer share $ cd lp_installer $ ./lp_setup_linux.sh
- ウィザードに従い、ライセンスパックをインストールする。
- 今回は、
/opt/BIOVIA/LicensePackにインストールした。
- csh をインストールする。
$ sudo apt install csh
- ライセンスを適用する。
$ cd /opt/BIOVIA/LicensePack/etc $ ./lp_config $ ./lp_echovars
- ライセンス場所の変更を適用する。
$ cd /opt/BIOVIA/DiscoveryStudio/bin $ ./config_lp_location /opt/BIOVIA/LicensePack